Нью-Йорк оказался очагом эпидемии ВИЧ, выяснили ученые

Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ) был занесен в США через Нью-Йорк в начале 1970 годов, один из жителей города заразился на Карибских островах, где ВИЧ стремительно распространялся 48-49 лет назад, говорится в статье в журнале Nature.

"Так называемый "пациент ноль", Гаэтан Дуга, сегодня стал одной из самых презираемых фигур в истории человечества, одним из длинной линии тех индивидов и групп людей, которые злонамеренно вызывали эпидемии. Мы показали, что он на самом деле не был корнем эпидемии ВИЧ, захлестнувшей США в 1980 годы", — рассказывает Ричард Маккей (Richard McKay) из Кембриджского университета (Великобритания).

© Фото: Worobey et al./Nature 2016

Карта первичного распространения ВИЧ по Америке

Геростратова опечатка 

Впервые ученые начали говорить о распространении новой, неизвестной науки болезни в 1981 году, когда медики в США столкнулись с необычными случаями иммунодефицита среди нескольких наркоманов и гомосексуалистов, живущих в Нью-Йорке и Калифорнии. Расследование этой истории привело к открытию нового ретровируса в 1983 году, получившего имя ВИЧ-1, и раскрытию своеобразной сети распространения этого вируса через нескольких геев, постоянно путешествующих по стране и вступавших в сотни и тысячи новых половых контактов. 

Один из этих людей, обозначенный в научных статьях как "пациент О" и ошибочно прочитанный прессой как "пациент ноль", занимал в этих сетях центральное место, так как он работал бортпроводником в одной из канадских авиалиний и постоянно путешествовал по Земле. Его имя – Гаэтан Дуга – было вычислено и увековечено журналистом Рэнди Шилтсом, писавшим в 1986 году книгу о ВИЧ.

Как объясняют ученые, медики в первые дни развития эпидемии  ВИЧ и СПИДа не знали о том, что первые симптомы иммунодефицита развиваются у зараженных людей не сразу, поэтому они посчитали, что Дуга занес вирус, как минимум, в Нью-Йорк и поспособствовал его распространению по Америке.

Маккей, историк по образованию, и ряд генетиков и биологов раскрыли настоящие корни современной глобальной эпидемии ВИЧ и сняли вину со знаменитого "пациента ноль", изучив образцы его крови и "воскресив" те штаммы вируса, которыми заражались американцы в первые дни экспансии "чумы 20 века".

Ученые подошли к решению этой проблемы неортодоксальным способом – они анализировали не образцы крови известных первых носителей ВИЧ, таких как Дуга, а сохранившиеся с 1970-х годов пробы мужчин-геев, проживавших в 1978-1979 годах в Нью-Йорке и Сан-Франциско, и проверявшиеся на заражение гепатитом С. Зачем генетики это сделали?

Генетическая некромантия

Как предположили Маккей и его коллеги, по крайней мере, часть ВИЧ-инфицированных, которых медики нашли в этих городах через "пациента ноль", уже и так должны были быть заражены вирусом в то время. Эта гипотеза оправдалась, и следы ВИЧ были найдены в нескольких десятках проб того времени, примерно в 6% от общего числа образцов крови из Нью-Йорка, и в 3% — из Сан-Франциско.

Ученые отобрали пять десятков таких "вещдоков" и попытались извлечь из них вирусные частицы и обрывки РНК вируса. Удалось сделать это лишь в восьми случаях, так как генетический код ВИЧ крайне короток – он состоит всего из 10 тысяч "букв"-нуклеотидов, и сами образцы деградировали за минувшие 45 лет.

Справившись с этой задачей, биологи сравнили эти геномы ВИЧ между собой, с устройством вируса Гаэтана Дуга и образцами ВИЧ, найденными в Африке, определяя степень их родства и положение на "древе эволюции" вируса иммунодефицита по числу мелких мутаций. Оказалось, что Дуга не был "пациентом ноль" – число мутаций в его вирусе и в вирусе американских геев из Калифорнии, тесно связанных с ним, указывало на то, что они не были самыми древними представителями их "ветви" эволюции, хотя и являлись их близкими родственниками.

На самом деле,  более древние и менее мутировавшие версии ВИЧ этого подтипа можно встретить в другой части Нового Света – на Карибских островах, где, как считают авторы статьи, вирус бурно распространялся с начала 1970-х годов, буквально каждый год удваивая популяцию зараженных людей. Вирус, согласно этой версии, появился на Гаити или Ямайке в 1967 году или даже раньше, куда был завезен из Африки.

По расчетам Маккея и его коллег, ВИЧ проник в США в 1971 или 1973 годах, попав сначала в Нью-Йорк вместе с иммигрантами с Гаити. После "миграции" в Америку вирус мутировал и начал  распространяться еще быстрее, удваивая свою "популяцию" каждые 0,8 года. Оттуда, вероятно вместе с людьми, похожими по стилю жизни на Дуга, он попал в Калифорнию в 1976 году и распространился по всей территории США, а затем и по всей Земле.